L’OMS, CARB-X et la FDA se mobilisent face à la crise de l’antibiorésistance

L’World Health Organization a publié des feuilles de route destinées à orienter le développement de nouveaux antibiotiques urgemment nécessaires pour trois types d’infections bactériennes. Les trois nouveaux profils de produit cible (target product profiles) portent sur les infections graves à bacilles gram négatifs multirésistants dues aux Enterobacterales résistants aux carbapénèmes, à Acinetobacter baumannii et à Pseudomonas aeruginosa ; les infections graves à bactéries gram positives résistantes aux antibiotiques chez les patients immunodéprimés et en état critique, avec un focus sur Enterococcus faecium ; ainsi que les méningites bactériennes communautaires et associées aux soins.

L’objectif des profils de produit cible est d’aider à accélérer le processus de développement des médicaments — et d’établir des priorités pour les chercheurs, les bailleurs de fonds et les développeurs — en définissant les caractéristiques souhaitées des nouveaux antibiotiques. Ils précisent l’utilisation visée, les populations cibles, le mécanisme d’action et la voie d’administration, et fixent des objectifs clairs en matière de qualité, de sécurité, d’efficacité, de pharmacocinétique, d’accès et d’abordabilité. Ils visent à faciliter, avec la plus grande célérité, le développement d’antibiotiques innovants répondant aux besoins de santé publique les plus importants et les plus urgents posés par la résistance aux antimicrobiens.

Ces trois types d’infections cibles sont actuellement traités par des antibiotiques qui deviennent moins efficaces à mesure que la résistance progresse, et l’arsenal de candidats en développement reste limité pour offrir de nouvelles options thérapeutiques. Les trois nouveaux profils de produit cible visent à aligner le développement des antibactériens sur la liste de l’OMS des agents pathogènes bactériens prioritaires, à prioriser les infections associées à une morbidité et une mortalité élevées, et à encourager le développement d’antibiotiques tout en réduisant les risques.

La communauté scientifique a mis au point et approuvé de nouveaux antibiotiques ces dernières années, mais cela ne suffit malheureusement pas à rattraper l’évolution des bactéries résistantes aux médicaments, en particulier celles qui suscitent le plus d’inquiétude, selon le directeur de la résistance aux antimicrobiens à l’World Health Organization.

CARB-X a annoncé l’attribution de 1,2 million de dollars à une équipe de recherche de Harvard University afin de développer des antibiotiques améliorés contre les bactéries multirésistantes. Ce financement soutiendra le développement préclinique d’une nouvelle classe d’antibiotiques ciblant le système de transport des lipoprotéines chez des agents pathogènes bactériens gram négatifs multirésistants — tels que Escherichia coli et Klebsiella pneumoniae — responsables d’infections urinaires, d’infections du sang et de pneumonies. Les lipoprotéines jouent un rôle crucial dans la pathogénicité et la résistance aux médicaments des bactéries gram négatives.

Les E. coli et K. pneumoniae résistants aux médicaments causent un nombre important d’infections potentiellement mortelles dans le monde, alors que le pipeline de nouveaux antibiotiques actifs sur les bacilles gram négatifs demeure dangereusement limité. La subvention soutient une approche hautement différenciée qui, si elle aboutit, ciblera ces agents pathogènes prioritaires via un mécanisme à spectre étroit conçu pour surmonter la résistance sans favoriser une résistance croisée plus large.

Il s’agit de la deuxième subvention que ce groupe reçoit de CARB-X. En 2024, l’équipe avait reçu 1,2 million de dollars pour développer des antibiotiques oraux améliorés par synthèse destinés aux infections des voies respiratoires inférieures résistantes aux médicaments, ainsi qu’aux infections cutanées et autres infections des tissus mous. Depuis sa création en 2016, CARB-X a financé 123 projets à un stade précoce visant à traiter, prévenir et diagnostiquer les infections résistantes aux antibiotiques. Quatorze de ces projets sont en développement clinique à un stade avancé, et trois ont atteint le marché.

La Food and Drug Administration a publié de nouvelles recommandations à l’intention des fabricants de médicaments vétérinaires afin de définir la durée d’utilisation des antibiotiques d’importance médicale chez les animaux d’élevage. Le document, publié le 12 février par le Center for Veterinary Medicine de la FDA, formule des recommandations aux promoteurs de médicaments destinés aux animaux sur la manière d’ajouter des limites de durée aux antibiotiques d’importance médicale utilisés chez les animaux producteurs de denrées alimentaires, pour des indications ne disposant actuellement d’aucune limite définie. Près de 30 % de tous les antibiotiques d’importance médicale utilisés chez les bovins, les porcs et la volaille dans les élevages américains ont au moins une indication sans durée d’utilisation définie, ce qui signifie que les agriculteurs peuvent administrer ces antibiotiques via l’alimentation animale pendant des périodes prolongées.

Le document Guidance for Industry #273 indique que l’étiquetage de ces produits devrait être révisé afin d’inclure des critères appropriés précisant quand commencer et quand arrêter l’administration de l’antimicrobien. Ces révisions devraient inclure une fourchette approximative de durée que les vétérinaires devraient envisager lors du traitement d’un animal, ainsi qu’une durée maximale à ne pas dépasser. Ces recommandations, non contraignantes, suggèrent également aux promoteurs d’éviter des instructions telles que « nourrir jusqu’au poids de marché » pour définir la durée d’utilisation.

La FDA présente ce document comme s’inscrivant dans ses efforts continus visant à promouvoir un usage prudent des antibiotiques d’importance médicale — également utilisés pour traiter des infections humaines — chez les animaux producteurs de denrées alimentaires. Plus des deux tiers de tous les antibiotiques d’importance médicale vendus dans le monde le sont pour traiter, contrôler et prévenir les infections bactériennes chez le bétail et la volaille.

Si les antibiotiques sont nécessaires pour traiter les animaux d’élevage atteints d’infections bactériennes, les défenseurs du bon usage des antibiotiques avertissent depuis longtemps que l’usage excessif et inapproprié des antibiotiques dans la production animale menace la santé animale et humaine en favorisant l’émergence et la propagation de la résistance aux antimicrobiens, ce qui réduit l’efficacité des antibiotiques. On estime que la résistance aux antimicrobiens cause plus de 1,2 million de décès chaque année.

Des recommandations antérieures publiées par la FDA avaient limité l’utilisation, dans les exploitations, des antibiotiques d’importance médicale au traitement, au contrôle et à la prévention des maladies, et imposé une prescription ainsi qu’une supervision vétérinaire pour toute utilisation d’antibiotiques. Avant ces changements, mis en œuvre en 2017, les agriculteurs américains pouvaient utiliser des antibiotiques d’importance médicale pour la promotion de la croissance et pouvaient les acheter sans ordonnance. En 2018, le Center for Veterinary Medicine avait appelé, dans son plan d’action quinquennal de soutien au bon usage des antimicrobiens en médecine vétérinaire, à ce que tous les antibiotiques utilisés dans l’alimentation et l’eau de boisson des animaux producteurs de denrées alimentaires aient « une durée d’utilisation correctement ciblée ».

Des critiques estiment que ces recommandations sont en deçà de ce qui est nécessaire pour répondre de manière adéquate à la hausse et à la propagation de la résistance aux antimicrobiens. Le problème, selon eux, est que le document demande aux fabricants de fixer les durées d’antibiothérapie uniquement en fonction des besoins de santé de l’animal, sans prendre en compte l’atténuation de la résistance aux antimicrobiens ni l’impact potentiel sur la santé humaine dans la prise de décision vétérinaire. Toujours selon les critiques, ces recommandations auront probablement très peu d’effet sur la quantité d’antibiotiques utilisée et, par conséquent, très peu de chances d’avoir un impact sur la résistance.

Une coalition de groupes a soumis des commentaires à la FDA lorsque le document était à l’état de projet. Parmi leurs demandes figurait l’établissement par la FDA d’une durée maximale par défaut de 21 jours pour tous les antibiotiques concernés et l’obligation, pour les fabricants, de fournir des données de sécurité microbiologique et d’efficacité s’ils souhaitent des durées maximales plus longues. Ils ont également exhorté la FDA à demander aux promoteurs de préciser, pour chaque indication figurant sur l’étiquetage d’un médicament, une durée d’utilisation définitive et limitée dans le temps, en plus de la durée maximale de 21 jours.