Avances en la tecnología CRISPR: nuevo punto de referencia en edición fuera de la diana, nuevos datos y acuerdo de licencia
El estudio de IDT mostró que UNCOVERseq logró una sensibilidad del 97,6% y una precisión del 78% para la identificación de sitios fuera de la diana de CRISPR. Scribe presentará nuevos datos en ASGCT y EAS, incluido STX-1150. Watchmaker obtuvo la licencia de la propiedad intelectual de CRISPR-Cas9 para la normalización de NGS.
Los anuncios recientes destacan avances significativos en el panorama de CRISPR, que abarcan la detección de sitios fuera de la diana, el desarrollo terapéutico y los flujos de trabajo de secuenciación. Integrated DNA Technologies (IDT), una empresa de Danaher, publicó un estudio revisado por pares en Nature Communications que establece un nuevo punto de referencia de rendimiento analítico para la identificación de sitios fuera de la diana de CRISPR y reporta que su flujo de trabajo UNCOVERseq logró la combinación más sólida de sensibilidad y precisión entre los métodos evaluados. Scribe Therapeutics también anunció que presentará nuevos datos sobre sus plataformas CRISPR diseñadas en las próximas reuniones científicas, y Watchmaker Genomics obtuvo la licencia de la propiedad intelectual fundacional de CRISPR-Cas9 de Caribou Biosciences para su uso en la preparación de bibliotecas de secuenciación de próxima generación (NGS).
El estudio dirigido por IDT, titulado 'UNCOVERseq Enables Sensitive and Controlled Gene Editing Off-Target Nomination Across CRISPR-Cas Modalities and Systems,' descubrió que UNCOVERseq logró un 97,6% de sensibilidad analítica y un 78% de precisión en los dos ARN guía utilizados para la comparación: la combinación más sólida de sensibilidad y precisión entre los métodos evaluados. La investigación, realizada con científicos de la Universidad de California en San Francisco, creó un conjunto de datos de evaluación comparativa entre métodos basado en la confirmación dirigida de posibles sitios fuera de la diana, lo que permite evaluar el rendimiento frente a la edición observada empíricamente en lugar del tamaño de la lista de candidatos de un método.
El estudio también define las condiciones operativas que influyen en la identificación de sitios fuera de la diana, incluyendo la replicación biológica, la cantidad de ADN genómico, la profundidad de secuenciación, la preparación de bibliotecas, los criterios de alineación y los controles de proceso. Los investigadores descubrieron que unas condiciones operativas insuficientes pueden limitar el rendimiento del método, mientras que los enfoques de baja precisión pueden generar listas de candidatos amplias que aumentan la carga de confirmación posterior, el tiempo y el coste. La publicación llega cuando la Administración de Alimentos y Medicamentos de EE. UU. (FDA) está considerando un proyecto de guía sobre el uso de la secuenciación de próxima generación y la bioinformática en estudios de seguridad no clínicos para productos de edición del genoma humano; el estudio se realizó de forma independiente y no representa una guía regulatoria.
Scribe Therapeutics participará en la 29.ª Reunión Anual de la Sociedad Estadounidense de Terapia Génica y Celular (ASGCT), que tendrá lugar del 11 al 15 de mayo en Boston y de forma virtual, y en el 94.º Congreso de la Sociedad Europea de Aterosclerosis (EAS), que se celebrará del 24 al 27 de mayo en Atenas, Grecia. En ASGCT, Scribe ofrecerá dos ponencias orales y una ponencia en taller que destacan los avances de sus tecnologías de edición del genoma ELXR y XE, incluido DeepXE, una plataforma de diseño CRISPR habilitada por IA para predecir la eficiencia de edición de las terapias basadas en XE. En el Congreso de la EAS, la empresa presentará datos preclínicos de última hora para STX-1150, su terapia de silenciamiento epigenético dirigida a PCSK9 diseñada para reducir los niveles de colesterol de lipoproteínas de baja densidad (LDL-C) sin inducir cambios permanentes en el ADN.
Watchmaker Genomics anunció una licencia no exclusiva con Caribou Biosciences sobre determinada propiedad intelectual fundacional de CRISPR-Cas9 para su uso en la preparación de bibliotecas de NGS. La empresa está utilizando CRISPR-Cas9 como una herramienta de unión programable y estequiométrica para abordar la normalización de bibliotecas, utilizando guías específicas de adaptadores para unir bibliotecas listas para secuenciar de forma controlada y permitir la estandarización de las entradas de biblioteca sin una cuantificación exhaustiva. El proceso no destructivo preserva la integridad y complejidad de la biblioteca, admite la resecuenciación o la ramificación del flujo de trabajo, y es compatible con los adaptadores existentes y los flujos de trabajo establecidos previos a la secuenciación. Watchmaker está adaptando además esta estrategia como componente central de una solución completa de secuenciación del genoma completo sin PCR diseñada para estudios de población a gran escala, detección neonatal y aplicaciones de enfermedades raras.
Scribe es una empresa de biotecnología que desarrolla tecnologías CRISPR optimizadas in vivo y medicamentos genéticos, con programas iniciales dirigidos a los impulsores de la enfermedad cardiovascular aterosclerótica, como el colesterol LDL elevado, la lipoproteína(a) y los triglicéridos. La empresa ha establecido colaboraciones estratégicas con Sanofi y Eli Lilly. Watchmaker Genomics desarrolla herramientas de alto rendimiento para la investigación genómica y aplicaciones clínicas, centrándose en áreas como la detección del cáncer, la epigenética y la biopsia líquida.