Des biomarqueurs de méthylation de l’ADN améliorent la prédiction de la survie dans le cancer colorectal

Des biomarqueurs dérivés de la méthylation de l’ADN, appelés Protein EpiScores, pourraient améliorer la précision de la prédiction de la survie sans maladie et de la survie globale chez les patients atteints d’un cancer colorectal (CRC), par rapport aux seuls facteurs de risque cliniques traditionnels, suggèrent les résultats d’une étude prospective. Ces résultats ont été publiés dans Clinical Epigenetics par des chercheurs du Moffitt Cancer Center, à Tampa (Floride).

La présente étude a porté sur 136 patients présentant un CRC nouvellement diagnostiqué, issus de l’étude prospective ColoCare Study. Pour chaque patient, les investigateurs ont mesuré 107 Protein EpiScores à partir d’échantillons de sang total prélevés avant traitement. La survie sans maladie et la survie globale ont été suivies pendant une durée médiane de 7,3 ans, et jusqu’à 13,8 ans. Au cours du suivi, 26 % des patients ont présenté une récidive de la maladie, et 35 % sont décédés.

Les investigateurs ont comparé le pouvoir prédictif des Protein EpiScores à celui des facteurs de risque cliniques traditionnels pour la survie sans maladie et la survie globale. Les facteurs standards incluaient le stade tumoral, l’âge au moment du diagnostic de cancer, le sexe, l’indice de masse corporelle, l’origine ethnique et la localisation de la tumeur.

Après ajustement sur les variables de confusion, les Protein EpiScores de HCII, VEGFA, CCL17 et LGALS3BP étaient chacun indépendamment associés à une survie sans maladie plus défavorable, avec des hazard ratios compris entre 1,62 et 1,71. L’ajout de ces scores au modèle clinique a amélioré l’indice de concordance (C-index), le faisant passer de 0,64 à 0,70.

Le Protein EpiScore LGALS3BP était également indépendamment associé à la survie globale, avec un hazard ratio de 1,80. L’ajout de ce score au modèle a fait augmenter le C-index de 0,70 à 0,75.

Les Protein EpiScores de HCII, LGALS3BP, MMP12 et VEGFA étaient associés à la fois à la survie sans maladie et à la survie globale, avec des hazard ratios supérieurs à 1,50.

L’amélioration de 6 points pour la récidive (C-index de 0,64 à 0,70) s’est traduite par une reclassification de 34 % des patients dans des catégories de risque plus précises. En oncologie, même des gains incrémentaux comptent s’ils permettent d’éviter de sous-traiter des patients à haut risque ou de sur-traiter des patients à faible risque.

Les Protein EpiScores ont été développés à partir de travaux antérieurs suggérant que les profils de méthylation de l’ADN pourraient améliorer la prédiction des maladies à partir de protéines circulantes (p. ex., la protéine C-réactive) et de traits physiologiques (p. ex., le statut tabagique), au-delà de la mesure directe de ces mêmes variables. « Les Protein EpiScores peuvent donc représenter une classe complémentaire de biomarqueurs par rapport aux mesures directes », ont écrit les investigateurs.

Des études précédentes ont évalué des horloges épigénétiques, dérivées de profils de méthylation de l’ADN, comme marqueurs du risque de CRC. Toutefois, ces horloges ne permettent pas d’identifier précisément des facteurs biologiques spécifiques à l’origine de la progression tumorale. Bien que les Protein EpiScores aient contribué à mettre au jour des processus biologiques impliqués dans diverses pathologies, telles que les maladies cardiovasculaires et le cancer, il s’agit de la première étude à les évaluer spécifiquement dans le contexte de la survie liée au cancer.

Les résultats actuels mettent en évidence des voies biologiques clés, notamment celles impliquant l’immunosuppression et la coagulation, qui pourraient contribuer à des issues plus défavorables chez les patients atteints de CRC. « La valeur immédiate de nos résultats est de mettre en lumière des voies biologiques telles que l’immunosuppression et la coagulation comme moteurs de mauvais pronostic », a déclaré un auteur senior du Moffitt Cancer Center. Ces informations peuvent orienter les chercheurs en sciences fondamentales et les études mécanistiques afin d’identifier d’éventuelles cibles thérapeutiques.

Bien que les Protein EpiScores nécessitent une validation supplémentaire avant de pouvoir être utilisés en pratique clinique, les chercheurs ont indiqué que si ces résultats étaient confirmés dans d’autres contextes épidémiologiques, ces Protein EpiScores pourraient, à terme, compléter les outils de risque existants ; toutefois, leur mise en œuvre clinique est, de façon réaliste, encore distante de plusieurs années. « Nous considérons ces résultats actuels davantage comme un outil de recherche nécessitant une validation dans des cohortes plus larges avant une utilisation clinique », a déclaré un auteur senior.

Les études futures pourraient également devoir recruter une population de patients plus diversifiée, étant donné que la cohorte actuelle était composée à 93 % de personnes blanches.