DNA甲基化生物标志物提升结直肠癌生存预测能力
一项前瞻性研究显示，基于DNA甲基化的 Protein EpiScores 在传统临床风险因素基础上可显著提高结直肠癌（CRC）无病生存与总生存的预测准确性。将相关评分纳入模型后，无病生存C-index由0.64升至0.70，总生存C-index由0.70升至0.75，但在临床应用前仍需在更大、更具多样性的队列中验证。
DNA甲基化衍生的生物标志物——称为 Protein EpiScores——与仅使用传统临床风险因素相比，可能提高结直肠癌（CRC）患者无病生存和总生存的预测准确性，一项前瞻性研究结果提示。相关发现由来自佛罗里达州坦帕的 Moffitt Cancer Center 研究人员发表于《Clinical Epigenetics》。
本研究纳入前瞻性 ColoCare Study 中136例新诊断 CRC 患者。研究人员为每位患者基于治疗前全血样本记录了107项 Protein EpiScores。研究在中位随访7.3年、最长13.8年的期间监测无病生存和总生存。随访期间，26%的患者出现疾病复发，35%的患者死亡。
研究人员比较了 Protein EpiScores 与传统临床风险因素在预测无病生存和总生存方面的能力。标准因素包括肿瘤分期、癌症诊断时年龄、性别、体重指数、种族以及肿瘤部位。
在校正混杂变量后，HCII、VEGFA、CCL17 和 LGALS3BP 的 Protein EpiScores 均与更差的无病生存独立相关，风险比介于1.62至1.71之间。将这些评分加入临床模型后，一致性指数（C-index）从0.64提高至0.70。
LGALS3BP Protein EpiScore 亦与总生存独立相关，风险比为1.80。将该评分加入模型后，C-index 从0.70提高至0.75。
HCII、LGALS3BP、MMP12 和 VEGFA 的 Protein EpiScores 与无病生存及总生存均相关，且风险比均高于1.50。
复发预测的6点提升（C-index 0.64至0.70）使34%的患者被重新归入更准确的风险类别。在肿瘤护理中，即便是小幅度的增益也具有意义——若能避免对高风险患者治疗不足或对低风险患者过度治疗。
Protein EpiScores 的开发基于既往研究：DNA甲基化谱可能在不直接测量相同变量的情况下，超越循环蛋白（例如 C反应蛋白）与生理特征（例如吸烟状态）的直接测量，用于改进疾病预测。“因此，Protein EpiScores 或可代表一种与直接测量相互补充的生物标志物类别，”研究人员写道。
既往研究曾评估由 DNA甲基化谱衍生的表观遗传时钟（epigenetic clocks）作为 CRC 风险标志物。然而，这些时钟无法定位驱动癌症进展的具体生物学因素。尽管 Protein EpiScores 已有助于揭示心血管疾病和癌症等多种状况的驱动生物过程，但本研究是首次在癌症生存这一特定语境下对其进行评估。
本研究结果指向若干关键生物通路，例如与免疫抑制和凝血相关的通路，可能驱动 CRC 患者更差的结局。Moffitt Cancer Center 的一位资深作者表示：“我们发现的直接价值在于凸显免疫抑制与凝血等生物通路是导致不良结局的驱动因素。”这些信息可为基础科学家与机制研究提供方向，以识别潜在治疗靶点。
尽管 Protein EpiScores 在进入临床应用前仍需进一步验证，研究人员指出，若在其他流行病学背景中得到验证，这些 Protein EpiScores 最终可能补充现有风险评估工具，但现实地说临床落地仍需数年。“我们认为这些当前发现更像是一种研究工具，在用于临床之前需要在更大规模队列中完成验证，”一位资深作者表示。
鉴于本队列中93%为白人，未来研究可能还需要招募更加多样化的患者人群。