Découverte de médicaments guidée par la génomique : étude CNV d'AstraZeneca, accord avec Helix, plateforme Quotient

AstraZeneca a publié une analyse à grande échelle des variants du nombre de copies (CNV) chez plus de 470 000 individus dans Nature, l'une des plus grandes études de ce type, et a conclu un accord pluriannuel avec Helix pour accéder à des données clinico-génomiques pour la découverte de médicaments. Par ailleurs, Quotient Therapeutics développe une plateforme de génomique somatique visant à identifier les mutations responsables de maladies.

La dernière étude, publiée dans Nature, caractérise les grandes délétions ou duplications d'ADN—appelées variants du nombre de copies (CNV)—pour créer l'une des plus grandes analyses de CNV à ce jour. Les résultats sont librement accessibles via le portail AZPheWAS. Selon AstraZeneca, les cibles thérapeutiques bénéficiant d'informations génétiques humaines ont jusqu'à sept fois plus de chances d'être approuvées comme médicaments. Lorsqu'une région est dupliquée, un gène peut produire trop de protéines, ce qui peut contribuer à la maladie; lorsqu'une région est supprimée, moins de protéines sont produites. Dans certains cas, des niveaux de protéines insuffisants peuvent réduire le risque de maladie, révélant des mécanismes naturels de protection appelés résilience génétique. L'analyse multi-ancestrale a identifié une duplication impliquant le gène HNF1B associée à des niveaux plus élevés de la protéine HNF1B et à une probabilité accrue de développer une maladie rénale chronique. Elle a également constaté qu'une délétion du gène IGHE réduit significativement les niveaux d'IgE et offre une protection naturelle contre le développement de l'asthme et des maladies allergiques.

Dans un développement séparé, Helix a annoncé avoir conclu un accord pluriannuel avec AstraZeneca, donnant au géant pharmaceutique accès à ses cohortes de recherche GenoSphere, y compris des données d'exome enrichi et des données cliniques longitudinales, pour la découverte et le développement de médicaments. Les conditions financières n'ont pas été divulguées. La base de données de Helix comprend des dossiers de santé électroniques couvrant en moyenne 13 ans par patient, des données d'exome clinique et de fond sur le génome entier, ainsi que des données de remboursement médical, pharmaceutique et de mortalité de tiers. Les participants ont donné leur consentement éclairé et peuvent être sollicités pour des études de suivi. Helix a conclu des accords similaires avec GlaxoSmithKline cette année et avec Alnylam l'année dernière.

Quotient Therapeutics développe une plateforme de génomique somatique qui combine un séquençage génomique très précis avec une analyse computationnelle pour identifier les mutations somatiques et les transformer en cibles médicamenteuses. Les mutations somatiques s'accumulent à mesure que les cellules se divisent et réagissent aux expositions environnementales, créant une variation génétique entre les tissus. Les taux de mutation sont constants dans le temps : un globule sanguin chez une personne de 60 ans aura deux fois plus de mutations qu'un globule sanguin d'une personne de 30 ans. Un adulte possède environ 10 milliards de clones de lymphocytes T, et à 60 ans, ils ont en moyenne 2 000 mutations par cellule, ce qui équivaut à 10 000 mutations générées dans les lymphocytes T chaque seconde. À 60 ans, chacune des 3 milliards de bases du génome est mutée en moyenne 6 000 fois. Les mutations somatiques jouent également un rôle causal dans la biologie de nombreuses maladies au-delà du cancer, certaines mutations protégeant les cellules contre les processus pathologiques et d'autres provoquant la maladie ; Quotient vise à développer des médicaments qui imitent les mutations protectrices ou inversent les effets des mutations responsables de maladies.