Descubrimiento de fármacos basado en genómica: estudio de CNV de AstraZeneca, acuerdo con Helix y plataforma de Quotient

AstraZeneca ha publicado un análisis a gran escala de variantes en el número de copias (CNV) en más de 470 000 individuos en Nature, uno de los estudios más grandes de este tipo, y ha firmado un acuerdo plurianual con Helix para acceder a datos clínico-genómicos para el descubrimiento de fármacos. Por separado, Quotient Therapeutics está avanzando en una plataforma de genómica somática destinada a descubrir mutaciones que impulsan enfermedades.

La última investigación, publicada en Nature, caracteriza grandes deleciones o duplicaciones de ADN —denominadas variantes en el número de copias (CNV)— para crear uno de los análisis de CNV más grandes hasta la fecha. Los resultados son de acceso abierto a través del portal AZPheWAS. Según AstraZeneca, los objetivos terapéuticos con conocimientos genéticos humanos tienen hasta siete veces más probabilidades de ser aprobados como medicamentos. Cuando una región se duplica, un gen podría producir demasiada proteína, lo que puede contribuir a la enfermedad; cuando una región se elimina, se produce menos proteína. En algunos casos, niveles insuficientes de proteína pueden reducir el riesgo de enfermedad, revelando mecanismos naturales de protección denominados resiliencia genética. El análisis multiétnico identificó una duplicación que involucra al gen HNF1B que se asocia con niveles más altos de la proteína HNF1B y una mayor probabilidad de desarrollar enfermedad renal crónica. También encontró que una deleción del gen IGHE reduce significativamente los niveles de IgE y ofrece protección natural contra el desarrollo de asma y enfermedades alérgicas.

En un desarrollo separado, Helix dijo que ha firmado un acuerdo plurianual con AstraZeneca, dando al gigante farmacéutico acceso a sus cohortes de investigación GenoSphere, incluidos datos clínicos exómicos mejorados y longitudinales, para el descubrimiento y desarrollo de fármacos. No se revelaron los términos financieros. La base de datos de Helix incluye registros de salud electrónicos que cubren un promedio de 13 años por paciente, datos de respaldo de exoma clínico y genoma completo, y reclamaciones de mortalidad, farmacia y médicas de terceros. Los participantes están totalmente consentidos y se puede contactar con ellos para estudios de seguimiento. Helix forjó acuerdos similares con GlaxoSmithKline este año y con Alnylam el año pasado.

Quotient Therapeutics está desarrollando una plataforma de genómica somática que combina la secuenciación del genoma de alta precisión con análisis computacional para identificar mutaciones somáticas y convertirlas en dianas farmacológicas. Las mutaciones somáticas se acumulan a medida que las células se dividen y responden a exposiciones ambientales, creando variación genética en los tejidos. Las tasas de mutación son constantes en el tiempo: una célula sanguínea de una persona de 60 años tendrá el doble de mutaciones que una de una persona de 30. Un adulto tiene alrededor de 10 mil millones de clones de linfocitos T y, a los 60 años, tienen, en promedio, 2 000 mutaciones por célula, lo que equivale a 10 000 mutaciones generadas en los linfocitos T cada segundo. A los 60 años, cada una de las 3 mil millones de bases del genoma está mutada 6 000 veces en promedio. Las mutaciones somáticas también desempeñan un papel causal en la biología de muchas enfermedades más allá del cáncer, y algunas mutaciones protegen a las células de los procesos de la enfermedad mientras que otras impulsan la enfermedad; Quotient tiene como objetivo desarrollar fármacos que imiten las mutaciones protectoras o reviertan los efectos de las mutaciones que impulsan la enfermedad.