泛癌空间分析在12种癌症中鉴定出13种肿瘤微环境生态位

一项泛癌研究在12种癌症类型中鉴定出56种局部细胞程序和13种空间生态位。多种生态位与患者预后、免疫治疗应答以及巨噬细胞的空间分布相关,揭示了肿瘤微环境组织结构的重要临床意义。

一项由中国科学院上海营养与健康研究所李宏教授领衔的研究,鉴定出泛癌范围内具有共识性的空间生态位,并解析了其分子特征和临床意义。该研究于4月17日发表于 Cell Reports Medicine。肿瘤微环境(TME)在肿瘤发生、进展、侵袭和转移中发挥关键作用,但由于样本量有限和计算挑战,泛癌TME的结构组成及其组织原则在很大程度上仍不清楚。

研究人员在不同尺度上定义了 56种局部细胞程序13种空间生态位,它们代表了 12种癌症类型 中具有共识性和基础性的空间结构单元。从机制上看,与生态位相关的配体-受体相互作用以及细胞类型特异性差异表达与生态位组织有关。

在临床上,多种生态位与患者预后和免疫治疗应答显著相关。巨噬细胞 在促肿瘤和抗肿瘤活性中都发挥双重作用,而这与其空间分布有关。

该研究为调控复杂肿瘤生态系统的细胞通信和结构影响提供了更深入的见解。研究还强调,巨噬细胞的空间分布是一个有前景的临床结局生物标志物。

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References

  1. Pan-cancer Spatial Analysis Decodes Tumor Microenvironment Architecture · english.cas.cn
  2. Sustained nitric oxide production by engineered E. coli remodels the tumor ... - Nature · nature.com
  3. Developing virtual physiology of human tumor tissue for malignancy assessment - Nature · nature.com