Pan-Cancer-Raumanalyse identifiziert 13 Nischen der Tumormikroumgebung in 12 Krebsarten
Eine pan-kanzerübergreifende Studie identifizierte 56 lokale zelluläre Programme und 13 räumliche Nischen in 12 Krebsarten. Mehrere dieser Nischen standen mit der Prognose, dem Ansprechen auf Immuntherapien und der räumlichen Verteilung von Makrophagen in Zusammenhang.
Ein Forschungsteam unter der Leitung von Prof. LI Hong vom Shanghai Institute of Nutrition and Health der Chinesischen Akademie der Wissenschaften identifizierte konsensbasierte räumliche Nischen über verschiedene Krebsarten hinweg und untersuchte ihre molekularen Merkmale sowie ihre klinischen Implikationen. Die Studie wurde am 17. April in Cell Reports Medicine veröffentlicht. Die Tumormikroumgebung (TME) spielt eine entscheidende Rolle bei Tumorentstehung, Progression, Invasion und Metastasierung, doch die strukturelle Zusammensetzung und die Organisationsprinzipien der pan-kanzerübergreifenden TME sind aufgrund begrenzter Stichprobengrößen und rechnerischer Herausforderungen bislang weitgehend unbekannt.
Die Forschenden definierten 56 lokale zelluläre Programme und 13 räumliche Nischen auf unterschiedlichen Ebenen, die konsensbasierte und fundamentale räumliche Struktureinheiten über 12 Krebsarten hinweg darstellen. Mechanistisch sind nischenbezogene Ligand-Rezeptor-Interaktionen und zelltypspezifische differentielle Genexpression mit der Organisation dieser Nischen assoziiert.
Klinisch zeigen mehrere Nischen signifikante Zusammenhänge mit der Prognose von Patientinnen und Patienten sowie mit dem Ansprechen auf Immuntherapien. Makrophagen spielen je nach ihrer räumlichen Verteilung eine doppelte Rolle mit sowohl tumorfördernden als auch antitumoralen Aktivitäten.
Die Studie liefert vertiefte Einblicke in die zelluläre Kommunikation und die strukturellen Einflüsse, die komplexe Tumorökosysteme steuern. Sie hebt zudem hervor, dass die räumliche Verteilung von Makrophagen einen vielversprechenden Biomarker für klinische Ergebnisse darstellt.