Analyse spatiale pancancéreuse : 13 niches du microenvironnement tumoral identifiées dans 12 cancers
Une étude pancancéreuse a identifié 56 programmes cellulaires locaux et 13 niches spatiales dans 12 types de cancer. Plusieurs de ces niches étaient associées au pronostic, à la réponse à l’immunothérapie et à la distribution spatiale des macrophages.
Une équipe de recherche dirigée par le Pr LI Hong, de l’Institut de nutrition et de santé de Shanghai de l’Académie chinoise des sciences, a identifié des niches spatiales consensuelles à travers les cancers et en a disséqué les caractéristiques moléculaires ainsi que les implications cliniques. L’étude a été publiée dans Cell Reports Medicine le 17 avril. Le microenvironnement tumoral (TME) joue un rôle critique dans la tumorigenèse, la progression, l’invasion et la métastatisation, mais la composition structurelle et les principes d’organisation du TME pancancéreux restent largement méconnus, en raison de la taille limitée des échantillons et des défis computationnels.
Les chercheurs ont défini 56 programmes cellulaires locaux et 13 niches spatiales à des échelles distinctes, qui représentent des unités structurelles spatiales consensuelles et fondamentales à travers 12 types de cancer. Sur le plan mécanistique, les interactions ligand-récepteur liées aux niches et l’expression différentielle spécifique aux types cellulaires sont associées à l’organisation des niches.
Sur le plan clinique, plusieurs niches présentent des associations significatives avec le pronostic des patients et la réponse à l’immunothérapie. Les macrophages jouent des rôles doubles, à la fois pro- et antitumoraux, en lien avec leur distribution spatiale.
L’étude apporte un éclairage plus approfondi sur la communication cellulaire et les influences structurelles qui régissent des écosystèmes tumoraux complexes. Elle souligne également que la distribution spatiale des macrophages constitue un biomarqueur prometteur des résultats cliniques.