Un análisis espacial pancáncer identifica 13 nichos del microambiente tumoral en 12 tipos de cáncer
Un estudio pancáncer identificó 56 programas celulares locales y 13 nichos espaciales en 12 tipos de cáncer. Varios nichos se asociaron con el pronóstico, la respuesta a la inmunoterapia y la distribución espacial de los macrófagos.
Un equipo de investigación dirigido por el Prof. LI Hong, del Instituto de Nutrición y Salud de Shanghái de la Academia China de Ciencias, identificó nichos espaciales de consenso en un análisis pancáncer y desentrañó sus características moleculares y sus implicaciones clínicas. El estudio se publicó en Cell Reports Medicine el 17 de abril. El microambiente tumoral (TME) desempeña un papel crítico en la tumorigénesis, la progresión, la invasión y la metástasis, pero la composición estructural y los principios de organización del TME pancáncer siguen siendo en gran medida desconocidos, debido al tamaño limitado de las muestras y a los desafíos computacionales.
Los investigadores definieron 56 programas celulares locales y 13 nichos espaciales a distintas escalas, que representan unidades estructurales espaciales de consenso y fundamentales en 12 tipos de cáncer. Desde el punto de vista mecanístico, las interacciones ligando-receptor relacionadas con los nichos y la expresión diferencial específica por tipo celular se asocian con la organización de los nichos.
En el plano clínico, múltiples nichos muestran asociaciones significativas con el pronóstico de los pacientes y la respuesta a la inmunoterapia. Los macrófagos desempeñan funciones duales, tanto pro como antitumorales, asociadas con sus distribuciones espaciales.
El estudio ofrece una comprensión más profunda de la comunicación celular y de las influencias estructurales que gobiernan los complejos ecosistemas tumorales. También destaca que la distribución espacial de los macrófagos representa un biomarcador prometedor para los resultados clínicos.