SLAS Technology第37巻、AI創薬設計と現場対応型診断を特集
SLAS Technology第37巻では、AI創薬ワークフローをElectronic Lab Notebookに組み込むフレームワーク、パイプライン型ベイズ最適化法PipeBO、現場導入可能なウイルス検出プラットフォームが紹介されている。創薬、実験自動化、植物病原体検出における実用的な技術進展を幅広く取り上げる内容となっている。
Volume 37 of SLAS Technologyには、テクニカルブリーフ1本、原著論文4本、文献ハイライト2本、そして「単一細胞の知見からRNAベース介入まで：トランスクリプトミクスを革新する」特集号からの掲載4本が含まれる。本巻では、使い慣れたElectronic Lab Notebookインターフェース内にAI創薬ワークフローを組み込む新規フレームワークと、実験室機器やコールドチェーン保管を必要とせず、35分未満でかんきつ類の葉からCitrus tristeza virusを検出できる携帯型プラットフォームが紹介されている。
テクニカルブリーフでは、使い慣れたElectronic Lab Notebookインターフェース内にAI創薬ワークフローを組み込む新規フレームワークを著者らが提案しており、高度なAIツールを、専門的な計算科学の知識を必要とせずにベンチケミストが利用できるようにしている。
原著論文の1つであるPipeBOは、新たに開発されたパイプライン型ベイズ最適化法であり、実験プロセスを重ね合わせることで処理時間を短縮し、逐次法と比べて最大56%の短縮を達成した。別の研究では、HSP90AB1がATP5A1およびPARK2の相互作用を調節することで、ミトコンドリア機能障害を介してpodocyte injuryを引き起こす機序が検討され、臨床検体およびマウス細胞株モデルで検証された。これらの知見は、podocyte injuryに対する新たな治療標的の可能性を示すとともに、その基礎にある病態メカニズムの理解を前進させる。
研究者らはまた、家禽農場の土壌からβ-lactamase産生性のPseudomonas songnenensisを分離し、酵素加水分解によりpenicillin、ampicillin、amoxicillinを含むβ-ラクタム系抗菌薬を分解できることを示した。この発見は、持続可能な畜産および食品生産システムにおいて、抗菌薬汚染を軽減するための新たなバイオレメディエーション戦略を提示するものである。
別の研究では、OmniLyseマイクロホモジナイゼーションと凍結乾燥RT-LAMPアッセイを組み合わせた携帯型プラットフォームが開発され、実験室機器やコールドチェーン保管なしに、35分未満でかんきつ類の葉からCitrus tristeza virusを検出できることが示された。このコールドチェーン不要で現場展開可能な技術は、植物病原体の迅速な現地検出を可能にし、他の農業病原体にも応用可能である。
文献ハイライトでは、ハイスループットゲノム編集プラットフォーム、自動化核酸抽出プロトコル、インテリジェントな菌株エンジニアリングシステムなどを含む、ラボオートメーション、マイクロ流体工学、AI強化バイオセンシングの最近の進展を取り上げている。システム遺伝学に関する特集号では、ハイスループットシーケンシングおよびマルチオミクス技術を活用して、遺伝子および分子相互作用ネットワークを解析し、遺伝的ネットワークが表現型にどのように影響するかを理解しようとしており、統合的なゲノム・エピゲノムアプローチを通じた個別化医療、治療標的探索、バイオマーカー同定を重視している。