Résistance aux antimicrobiens : nouveaux financements, conception d'antibiotiques et détection plus rapide de la résistance

Des chercheurs et des gouvernements ont annoncé de nouveaux financements et des avancées scientifiques visant à lutter contre la résistance aux antimicrobiens (RAM), notamment une subvention de 3,1 millions de livres sterling à Imperial College London, une nouvelle approche de conception d'antibiotiques et un test plus rapide et moins coûteux pour la résistance à la fidaxomicine. Ces initiatives ciblent les infections résistantes aux médicaments, comme celles à Klebsiella et à Clostridioides difficile, tandis que l'Inde a dévoilé de nouvelles subventions pour la recherche sur les maladies fongiques et la RAM.

Des chercheurs de la Fleming Initiative d'Imperial ont obtenu un financement de 3,1 millions de livres sterling sur trois ans grâce à un nouveau programme de la Fondation Gates, de la Fondation Novo Nordisk et de Wellcome. Ce financement supplémentaire, attribué dans le cadre du prix Gr-ADI (Gram-Negative Antibiotic Discovery Innovator), élargira un Grand Challenge annoncé conjointement en 2025 avec GSK. L'équipe pluridisciplinaire du projet vise à élaborer un « rulebook » pour accélérer la découverte de nouvelles molécules médicamenteuses afin de contribuer à lutter contre la résistance des pathogènes à Gram négatif. L'accent initial mis sur E. coli sera désormais étendu aux bactéries Klebsiella. Klebsiella est une cause fréquente d'infections nosocomiales, notamment de pneumonies, d'infections urinaires et d'infections chirurgicales, et elle est de plus en plus résistante aux antibiotiques. Le projet est l'un des 18 menés par des équipes de recherche dans 17 pays. Le portefeuille GrADI totalise 60 millions de dollars et soutient un effort intégré couvrant l'identification de cibles, la protéomique, les criblages génétiques et chimiques, des études d'accumulation de composés à très haut débit, couplées à une modélisation itérative par intelligence artificielle et apprentissage automatique (IA/ML).

Une nouvelle méthode de conception d'antibiotiques, décrite sous le nom d'Efflux Resistance Breaker (ERB), est présentée dans le Journal of Medicinal Chemistry par des chercheurs du King's College London. De nombreuses bactéries utilisent des pompes moléculaires, appelées pompes d'efflux, pour expulser les antibiotiques de la cellule avant que les médicaments n'atteignent des concentrations suffisantes pour les tuer. L'équipe dirigée par King's a montré que les antibiotiques peuvent être chimiquement reconçus afin d'être moins facilement éliminés par ces pompes, ce qui permet à l'antibiotique de rester dans la cellule bactérienne à des concentrations plus élevées. Contrairement aux stratégies précédentes qui associaient des antibiotiques à des inhibiteurs de pompes d'efflux séparés, cette nouvelle approche intègre directement des propriétés de rupture de résistance dans la molécule antibiotique. « La résistance aux antimicrobiens augmente, mais le nombre d'antibiotiques véritablement nouveaux en développement reste inquiétant », a déclaré un professeur de chimie médicinale au King's College London. L'étude apporte une preuve de concept que le maintien d'une concentration intracellulaire élevée d'antibiotique peut aider à surmonter la résistance, y compris chez des bactéries qui présentent déjà une sensibilité réduite aux antibiotiques existants. Les chercheurs pensent que la plateforme ERB pourrait être utilisée comme stratégie générale pour concevoir des antibiotiques dotés d'une résilience intégrée à la résistance médiée par l'efflux.

Lors de l'ASM Microbe 2026 à Washington, D.C., des chercheurs de Cleveland ont décrit une nouvelle méthode de détection rapide de la résistance à la fidaxomicine chez Clostridioides difficile. La méthode consiste à ajouter directement de la fidaxomicine au milieu de culture standard, la gélose Brucella pour C. difficile. Dans une étude portant sur 126 échantillons de selles déjà testés positifs pour C. difficile, le milieu enrichi en antibiotique a correctement identifié les isolats résistants avec une sensibilité de 100 %. Les chercheurs estiment que pour 1 000 patients dépistés, l'utilisation du nouveau milieu permettra d'économiser 201 heures de travail et 9 075 dollars en fournitures et en main-d'œuvre. Les infections à C. difficile touchent 500 000 personnes aux États-Unis chaque année, selon les Centres pour le contrôle et la prévention des maladies, et jusqu'à 30 000 décèdent dans les 30 jours suivant le diagnostic. Cette nouvelle approche pourrait facilement être déployée à plus grande échelle dans les services de santé publique et les laboratoires de recherche une fois les résultats préliminaires validés.

En Inde, le gouvernement de l'Union pousse au financement de la recherche pour catalyser une innovation plus rapide dans les maladies fongiques et les médicaments contre la résistance aux antimicrobiens. Grâce à de nouvelles initiatives de financement, à des réseaux de surveillance renforcés, à des investissements dans le diagnostic avancé et la découverte de médicaments antifongiques, le pays accélère ses efforts pour améliorer la détection, la surveillance et le traitement des infections fongiques potentiellement mortelles. Les National Health Research Priority Projects accordent des subventions allant jusqu'à 25 crore de roupies sur cinq ans pour des recherches à fort impact. MedTech Mitra, une initiative conjointe de NITI Aayog, de l'Indian Council of Medical Research (ICMR) et de la Central Drugs Standard Control Organisation (CDSCO), vise à accélérer le développement de thérapeutiques, de vaccins, de dispositifs médicaux, de diagnostics in vitro et de technologies d'assistance abordables, accessibles et locaux. L'ICMR étend la surveillance via des réseaux comme MycoNet, avec le Centre for Advanced Research proposant 15 crore de roupies sur 5 ans, et une subvention First in World Challenge pouvant aller jusqu'à 8 crore de roupies pour accélérer la recherche translationnelle de bout en bout. Une conférence internationale sur les maladies fongiques et la résistance aux antimicrobiens, organisée par la Foundation for Neglected Disease Research, l'University of Aberdeen et Brigid Bio, avec le soutien financier de FAILSAFE, a réuni des leaders d'opinion clés du monde universitaire, de l'industrie, de l'ICMR et des start-ups du Royaume-Uni et de l'Inde.