脂质纳米颗粒递送完整CFTR基因:囊性纤维化基因治疗取得新进展
UCLA研究团队开发出一种基于脂质纳米颗粒的非病毒基因编辑策略,可将完整的CFTR基因精准插入人气道细胞基因组。在囊性纤维化实验室模型中,即便仅纠正3–4%的细胞,也能将CFTR通道功能恢复至正常的88%–100%,为不依赖突变类型的基因治疗提供了新方向。
UCLA研究人员开发出一种基于脂质纳米颗粒(lipid nanoparticle, LNP)的基因编辑方法,能够将一条完整的健康基因插入人类气道细胞,在囊性纤维化的实验室模型中恢复关键生物学功能,并为遗传性肺病提供一种不依赖具体突变类型(mutation-agnostic)的基因治疗新路径。该研究发表在《Advanced Functional Materials》上,结果显示,脂质纳米颗粒可被工程化改造,用于携带实现精准插入一条大型全长基因所需的复杂分子“载荷”,并在不使用病毒载体(viral vectors)的情况下将其整合进基因组。
“这项工作表明,我们可以把精准基因插入所需的一切都封装进一个单一的、非病毒递送系统中。这是开发可覆盖多种致病突变的基因疗法迈出的关键一步。”研究资深作者、UCLA Broad Stem Cell Research Center的一名成员表示。
囊性纤维化由单个基因的突变引起,即囊性纤维化跨膜传导调节因子(cystic fibrosis transmembrane conductance regulator),或 CFTR。该基因编码一种通道蛋白,帮助氯离子和水分跨越气道细胞表面运输。当这一通道功能异常时,肺部黏液会变得浓稠黏滞,导致细菌被困并引发慢性感染与进行性肺损伤。尽管被称为CFTR调节剂(CFTR modulators)的高效药物已改变了许多囊性纤维化患者的治疗格局,但约10%的患者几乎不产生或完全不产生CFTR蛋白,使得这些药物无从发挥作用。
“对这些患者而言,基因治疗不只是改进——它确实是唯一的选择。”该研究一位共同作者、干细胞中心转化研究副主任说,“你首先必须让细胞具备制造这种蛋白的能力。”
由于可导致囊性纤维化的CFTR基因突变超过1,700种,研究团队希望开发一种通用策略:通过一次编辑即可纠正任意一种错误,而不是逐个突变分别处理。大多数实验性基因治疗依赖病毒载体将遗传物质递送至细胞内。尽管病毒方法递送能力强,但其生产成本可能较高、可携带的遗传物质容量有限,而且由于免疫系统可能识别并产生反应,往往难以重复给药。
UCLA团队转而采用脂质纳米颗粒作为非病毒递送系统。这些颗粒被工程化设计,可同时运输三种基因编辑组成部分:用于在特定位点切割DNA的 CRISPR machinery,用于靶向正确基因组位点的引导分子,以及一段编码完整、功能性CFTR基因拷贝的DNA模板。
该研究第一作者、UCLA Jonas实验室近期毕业的博士表示:“把所有这些装进同一个颗粒里——尤其是像CFTR这样大的基因——此前还没有被证明可行。若能解决‘大基因’难题,也将为许多其他疾病打开大门。”
研究人员在实验室培养的人气道细胞中测试了该系统,这些细胞携带一种对现有药物无反应的重度囊性纤维化突变。纳米颗粒成功将健康的CFTR基因递送并整合进约3–4%的细胞中。尽管被纠正的细胞比例相对较小,该治疗仍在整体细胞群体中将 CFTR通道功能恢复到正常水平的88%至100%。
研究人员称,这种强劲的功能恢复不仅取决于基因插入的位置,也与其工程化设计有关。替换用的CFTR基因在进入细胞后被设计为最大化蛋白产量,使得即便只有少量被纠正的细胞也能产生超出比例的效果。这种基因设计被称为 codon optimization,由UCLA某实验室的合作团队开发,可在不改变蛋白本身的情况下提升CFTR蛋白的生成。
与递送信使RNA(messenger RNA)的方法不同——后者必须反复重复给药——该新策略将纠正后的基因直接插入基因组,可能使细胞及其后代能够在较长时间内持续产生功能性CFTR。不过,要获得长期获益,基因编辑最终需要触达气道干细胞,它们位于肺部保护性内衬更深处,并在人的一生中不断再生气道组织。
“这些干细胞寿命长,并持续再生气道。”UCLA David Geffen School of Medicine的一位共同作者、同时担任儿科与肺科医学教授表示,“如果能纠正它们,从理论上讲,就能获得持续的健康细胞来源。”
而如何到达这些细胞仍是未来最大的挑战之一。气道的结构本就旨在阻挡外来颗粒,在囊性纤维化患者中,浓稠的黏液又形成了额外屏障。