AI识别的肽在小鼠中减轻溃疡性结肠炎症状

研究人员利用机器学习识别出一种名为 LR 的抗菌肽,可在小鼠溃疡性结肠炎模型中减轻炎症、改善肠道屏障功能并重塑微生物群。该肽在该模型中的表现优于 5-aminosalicylic acid 和 ciprofloxacin,显示出潜在治疗前景。

研究人员利用机器学习识别出一种新的抗菌肽,该肽可在溃疡性结肠炎中减轻炎症、恢复肠道屏障功能并重塑微生物群。来自吉林大学第一医院的一项研究显示,名为 LR 的肽在抗菌活性与低细胞毒性之间表现出最理想的平衡,并且在小鼠结肠炎模型中的效果强于 5-aminosalicylic acidciprofloxacin

该研究开发了一条机器学习流程,将肽预测模型与遗传算法相结合,以分析 6,000 多个潜在候选物的结构和理化性质。研究筛选出 22 条前景较好的序列,并合成了 5 种肽用于实验室测试。

体外实验显示,LR 对包括 Escherichia coliStaphylococcus aureus 在内的致病菌具有很强的杀菌作用,同时保持了良好的生物相容性;与其他候选肽相比,其毒性极低,溶血活性也较低。

为测试其治疗潜力,研究人员向葡聚糖硫酸钠诱导的结肠炎小鼠给予 LR。治疗后,小鼠体重下降减少、疾病活动指数改善、结肠缩短程度减轻;同时,组织学分析显示黏膜损伤减少,炎症细胞浸润下降。

进一步分析发现,LR 可抑制炎症反应,治疗后 tumour necrosis factor-αinterleukin-6 水平均显著降低。该肽还提高了紧密连接蛋白 ZO-1claudin-1occludin 的表达,提示上皮屏障功能得到改善。

粪便微生物群测序显示,治疗重塑了结肠炎小鼠的微生物组成。Akkermansia muciniphila 的丰度显著增加,而单独补充 A. muciniphila 也可部分缓解结肠炎症状,这提示微生物群调节对 LR 的治疗作用有所贡献。

研究结果表明,将计算筛选与实验验证相结合,可识别出在溃疡性结肠炎中具有抗炎活性、且稳定并具选择性的抗菌肽。研究指出,仍需开展更多研究,以评估其长期安全性及在人类中的适用性。

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References

  1. Machine Learning Model Predicts Recurrent Clostridioides difficile Infection in Patients With ... · journals.lww.com
  2. AI discovers peptide that eases ulcerative colitis symptoms - Drug Target Review · drugtargetreview.com
  3. Diet and routine stool tests could help predict IBD flares, large study suggests · medicalnewstoday.com